Validace a interpretace modulovaných struktur

Anotace

Modulované krystaly se vyznačují porušením trojrozměrné translační symetrie. Jejich struktury jsou počítány metodami programu JANA2006. Podle našich odhadů se vědci během stoleté existence krystalografie setkali se zhruba šesti tisíci modulovanými strukturami. V důsledku technických omezení, náročnosti metod a nedostatku interpretačních nástrojů z nich však byla plně vyřešena a publikována pouze část. Náš projekt se zabývá validací a interpretací (3+1)-rozměrných modulovaných struktur. Budou vyvinuty snadno použitelné nástroje pro manipulaci, validaci a vizualizaci modulovaných CIF souborů, nástroje pro rozbor čtyřrozměrných Fourierových map a dále prostředky pro průzkum geometrie modulovaných struktur včetně nevazebných interakcí. Chyby v určení struktury budou přehledně indikovány pomocí tzv. alertů. Navrhované prostředky interpretace a validace budou začleněny do programu JANA2006 a propojeny s databázi modulovaných struktur v Bilbau. Usnadněním práce autorů i editorů dosáhneme lepšího poměru publikovaných a odložených modulovaných struktur.