1. Nature Communications 14 (2023) 4954 -4954 .
  2. F. Frezza, A. Sánchez-Grande, M. Ondráček, M. Vondráček, Q. Chen, O. Stetsovych, V. Villalobos-Vilda, E. Tosi, F. J. Palomares, M. F. López, C. Sánchez-Sánchez, K.-H. Ernst, J. A. Martín-Gago, J. Honolka, P. Jelínek
    Journal of Physics: Condensed Matter 35 (2023) 335001(1)-335001(9).
  3. Ch. Wäckerlin, A. Cahlík, J. Goikoetxea, O. Stetsovych, D. Kývala, J. R. López Roso Redondo, M. Švec, B. Delley, M. Ondráček, A. Pinar Solé, M. Blanco-Rey, J. Kolorenč, A. Arnau, P. Jelínek
    ACS Nano 16 (2022) 16402-16413.
  4. B. Lowe, J. Hellerstedt, A. Matěj, P. Mutombo, D. Kumar, M. Ondráček, P. Jelínek, A. Schiffrin
    Journal of the American Chemical Society 144 (2022) 21389-21397.
  5. J. Su, W. Fan, P. Mutombo, X. Peng, Sh. Song, M. Ondráček, P. Golub, J. Brabec, L. Veis, M. Telychko, P. Jelínek, J. Wu, J. Lu
    Nano Letters 21 (2021) 861-867.
  6. V. M. Santhini, Ch. Wäckerlin, A. Cahlík, M. Ondráček, S. Pascal, A. Matěj, O. Stetsovych, P. Mutombo, P. Lazar, O. Siri, P. Jelínek
    Angewandte Chemie International Edition 60 (2021) 439-445.
  7. Advanced Functional Materials 31 (2021) 2006391(1)-2006391(11).
  8. K. Scheil, M. Gruber, M. Ondráček, R. Berndt
    Journal of Physical Chemistry C 124 (2020) 26889-26896.
  9. J. Berger, M. Ondráček, O. Stetsovych, P. Malý, P. Holý, J. Rybáček, M. Švec, I.G. Stará, T. Mančal, I. Starý, P. Jelínek
    Nature Communications 11 (2020) 1337-1-1337-10.
  10. B. Cirera, B. De La Torre Cerdeño, D. Moreno, M. Ondráček, R. Zbořil, R. Miranda, P. Jelínek, D. Écija
    Chemistry of Materials 31 (2019) 3248-3256.
  11. J. Peng, J. Guo, P. Hapala, D. Cao, R. Ma, B. Cheng, L. Xu, M. Ondráček, P. Jelínek, E. Wang, Y. Jiang
    Nature Communications 9 (2018) 122(1)-122(7).
  12. Philosophical Magazine 98 (2018) 1131-1150.
  13. Chapter 16 in Kelvin Probe Force Microscopy, eds. S. Sadewasser & T. Glatzel, Springer Series in Surface Sciences, vol. 65, Springer, Cham, 2018, pp. 499-518
  14. O. Krejčí, P. Hapala, M. Ondráček, P. Jelínek
    Physical Review B 95 (2017) 045407(1)-045407(9).
  15. J. Onoda, M. Ondráček, P. Jelínek, Y. Sugimoto
    Nature Communications 8 (2017) 15155(1)-15155(6).
  16. P. Hapala, M. Švec, O. Stetsovych, N. J. van der Heijden, M. Ondráček, J. van der Lit, P. Mutombo, I. Swart, P. Jelínek
    Nature Communications 7 (2016) 11560(1)-11560(8).
  17. Nanotechnology 27 (2016) 274005(1)-274005(13).
  18. K. Iwata, Sh. Yamazaki, P. Mutombo, P. Hapala, M. Ondráček, P. Jelínek, Y. Sugimoto
    Nature Communications 6 (2015) 7766(1)-7766(6).
  19. F. Albrecht, J. Repp, M. Fleischmann, M. Scheer, M. Ondráček, P. Jelínek
    Physical Review Letters 115 (2015) 076101-1-076101-5.
  20. M. Corso, M. Ondráček, Ch. Lotze, P. Hapala, K. J. Franke, P. Jelínek, J. I. Pascual
    Physical Review Letters 115 (2015) 136101(1)-136101(5).
  21. M. Telychko, P. Mutombo, P. Merino, P. Hapala, M. Ondráček, F.C. Bocquet, J. Sforzini, O. Stetsovych, M. Vondráček, P. Jelínek, M. Švec
    ACS Nano 9 (2015) 9180-9187.
  22. Noncontact Atomic Force Microscopy vol. 3
  23. J. Onoda, M. Ondráček, A, Yurtsever, P. Jelínek, Y. Sugimoto
    Applied Physics Letters 104 (2014) 133107(1)-133107(4).
  24. M. Švec, P. Hapala, M. Ondráček, P. Merino, M. Blanco-Rey, P. Mutombo, M. Vondráček, Y. Polyak, J. A. Martín Gago, P. Jelínek
    Physical Review B 89 (2014) 201412(1)-201412(5).
  25. ACS Nano 8 (2014) 7318-7324.
  26. Z. Majzik, B. Drevniok, W. Kamiński, M. Ondráček, A. B. McLean, P. Jelínek
    ACS Nano 7 (2013) 2686-2692.
  27. A. Yurtsever, Y. Sugimoto, H. Tanaka, M. Abe, S. Morita, M. Ondráček, P. Pou, R. Pérez, P. Jelínek
    Physical Review B 87 (2013) 155403(1)-155403(10).
  28. A. J. Weymouth, D. Meuer, P. Mutombo, T. Wutscher, M. Ondráček, P. Jelínek, F. J. Giessibl
    Physical Review Letters 111 (2013) 126103(1)-126103(4).
  29. Y. Sugimoto, M. Ondráček, M. Abe, P. Pou, S. Morita, R. Pérez, F. Flores, P. Jelínek
    Physical Review Letters 111 (2013) 106803(1)-106803(5).
  30. Y. Sugimoto, A. Yurtsever, M. Abe, S. Morita, M. Ondráček, P. Pou, R. Pérez, P. Jelínek
    ACS Nano 7 (2013) 7370-7376.
  31. P. Sobotík, M. Setvín, P. Zimmermann, P. Kocán, I. Ošt’ádal, P. Mutombo, M. Ondráček, P. Jelínek
    Physical Review B 88 (2013) 205406(1)-205406(7).
  32. M. Ondráček, C. González, P. Jelínek
    Journal of Physics: Condensed Matter 24 (2012) 084003(1)-084003(7).
  33. Journal of Physics: Condensed Matter 24 (2012) 084001(1)-084001(10).
  34. M. Setvín, P. Mutombo, M. Ondráček, Z. Majzik, M. Švec, V. Cháb, I. Ošťádal, P. Sobotík, P. Jelínek
    ACS Nano 6 (2012) 6969-6976.
  35. M. Ondráček, P. Mutombo, Z. Chvoj, A. G. Mark, Z. Chromcová, A.B. McLean, P. Jelínek
    Journal of Physics: Condensed Matter 24 (2012) 445003-445016.
  36. A. Campbellová, M. Ondráček, P. Pou, R. Pérez, P. Klapetek, P. Jelínek
    Nanotechnology 22 (2011) 295710(1)-295710(7).
  37. M. Ondráček, P. Pou, V. Rozsíval, C. González, P. Jelínek, R. Pérez
    Physical Review Letters 106 (2011) 176101(1)-176101(4).
  38. Physical Review B 81 (2010) 064410(1)-064410(8).
  39. e-Journal of Surface Science and Nanotechnology 8 (2010) 157-160.
  40. e-Journal of Surface Science and Nanotechnology 8 (2010) 184-189.
  41. Physical Review B 78 (2008) 054413-1-054413-6.
  42. Journal of Physics: Conference Series 61 (2007) 894-898.
  43. Surface Science 601 (2007) 4261-4265.
  44. Czechoslovak Journal of Physics 56 č.1 (2006) 69-74.
  45. M. Ondráček, F. Máca, J. Kudrnovský, J.Redinger, A.Biedermann, C.Fritscher, M.Schmid, P.Varga
    Physical Review B 74 (2006) 235437(1)-235437(7).
  46. Theoretical calculations for the interpretation of STM images.
    Československý časopis pro fyziku 56 (2006) 65-73.