1. M. Švec, P. Hapala, M. Ondráček, P. Merino, M. Blanco-Rey, P. Mutombo, M. Vondráček, Y. Polyak, J. A. Martín Gago, P. Jelínek
    Physical Review B 89 (2014) 201412(1)-201412(5).
  2. P. Hapala, G. Kichin, Ch. Wagner, F. S. Tautz, R. Temirov, P. Jelínek
    Physical Review B 90 (2014) 085421(1)-085421(9).
  3. ACS Nano 8 (2014) 7318-7324.
  4. E. J. Spadafora, J. Berger, P. Mutombo, M. Telychko, M. Švec, Z. Majzik, A. B. McLean, P. Jelínek
    Journal of Physical Chemistry C 118 (2014) 15744-15753.
  5. J. Onoda, M. Ondráček, A, Yurtsever, P. Jelínek, Y. Sugimoto
    Applied Physics Letters 104 (2014) 133107(1)-133107(4).
  6. Advanced Materials Interfaces 1 (2014) 1300042(1)-1300042(9).
  7. P. Merino, M. Švec, J.I. Martinez, P. Jelínek, P. Lacovig, M. Dalmiglio, S. Lizzit, P. Soukiassian, J. Cernicharo, J.A. Martin-Gago
    Nature Communications 5 (2014) 3054(1)-3054(9).
  8. P. Hapala, R. Temirov, F. S. Tautz, P. Jelínek
    Physical Review Letters 113 (2014) 226101(1)-226101(5).
  9. M. Setvín, P. Mutombo, M. Ondráček, Z. Majzik, M. Švec, V. Cháb, I. Ošťádal, P. Sobotík, P. Jelínek
    ACS Nano 6 (2012) 6969-6976.
  10. M. Ondráček, P. Mutombo, Z. Chvoj, A. G. Mark, Z. Chromcová, A.B. McLean, P. Jelínek
    Journal of Physics: Condensed Matter 24 (2012) 445003-445016.
  11. Z. Majzik, M. Setvín, A. Bettac, A. Feltz, V. Cháb, P. Jelínek
    Beilstein Journal of Nanotechnology 3 (2012) 249-259.
  12. M. Ondráček, C. González, P. Jelínek
    Journal of Physics: Condensed Matter 24 (2012) 084003(1)-084003(7).
  13. Journal of Physics: Condensed Matter 24 (2012) 084001(1)-084001(10).
  14. A. Yurtsever, D. Fernandez-Torre, C. Gonzalez, P. Jelínek, P. Pou, Y. Sugimoto, M. Abe, R. Perez, S. Morita
    Physical Review B 85 (2012) 125416(1)-125416(9).
  15. M. Švec, P. Merino, Y. J. Dappe, C. González, E. Abad, P. Jelínek, J. A. Martín-Gago
    Physical Review B 86 (2012) 121407(R)-121412(R).
  16. H. Vázquez, P. Jelínek, M. Brandbyge, A.P. Jauho, F. Flores
    Applied Physics A-Materials Science & Processing 95 (2009) 257-263.
  17. M. Švec, V. Dudr, M. Vondráček, P. Jelínek, P. Mutombo, V. Cháb, F. Šutara, V. Matolín, K. Prince
    Surface Science 603 (2009) 2861-2869.
  18. P. Pou, S.A. Ghasemi, P. Jelínek, T. Lenosky, S. Goedecker, R. Perez
    Nanotechnology 20 (2009) 264015-1-264015-10.
  19. R. Bechstein, C. González, J. Schütte, P. Jelínek, R. Pérez, A. Kühnle
    Nanotechnology 20 (2009) 505703(1)-505703(7).
  20. K. Košmider, A. Krupski, P. Jelínek, L. Jurczyszyn
    Physical Review B 80 (2009) 115424(1)-115424(7).
  21. S. Sadewasser, P. Jelínek, Ch.K. Fang, O.Custance, Y. Yamada, Y.Sugimoto, M.Abe, S.Morita
    Physical Review Letters 103 (2009) 266103(1)-266103(4).
  22. P. Pou, P. Jelínek, R. Pérez
    Chapter 11 in Noncontact Atomic Force Microscopy, eds. S.Morita, F.J. Giessibl, R. Wiesendanger, in series NanoScience and Technology, vol. 2, Springer-Verlag Berlin Heidelberger 2009 pp. 227-248.
  23. Y. Sugimoto, P. Pou, M. Abe, P. Jelínek, R. Pérez, S. Morita, Ó. Custance
    Nature 446 (2007) 64-67.
  24. Y.Sugimoto, P. Jelínek, P.Pou, M.Abe, S.Morita, R. Perez, O. Custance
    Physical Review Letters 98 (2007) 106104-1-106104-4.
  25. M.A. Basasnta, Y.J. Dappe, P. Jelínek, J. Ortega
    Computational Materials Science 39 (2007) 759-766.
  26. Z. Kuntová, P. Jelínek, V. Cháb, Z. Chvoj
    Single atom diffusion of Pb on a Si(111)-7x7 surface.
    Surf. Sci. 566-568 (2004) 130 - 136
  27. W. Kaminski, P. Jelínek, R. Pérez, F. Flores, J. Ortega
    Si-substitutional defects on the alpha-Sn-Si(111)-(r3xr3) surface.
    Appl. Surf. Sci. 234 (2004) 286 - 291
  28. P. Jelínek, R. Peréz, J. Ortega, F. Florez
    Mechanical properties and electrical conductance of different Al nanowire submitted to an homogeneous deformation: a first-principles simulation.
    Surf. Sci. 566-568 (2004) 13 - 23
  29. J. M. Blanco, C. Gonzáles, P. Jelínek, J. Ortega, F. Flores, R. Peréz
    First-principles simulations of STM images: From tuneling to the contact regime.
    Phys. Rev. B 70 (2004) 85405