1. K. Biswas, J.I. Urgel, A. Sánchez-Grande, S. Edalatmanesh, J. Santos, B. Cirera, P. Mutombo, K. Lauwaet, R. Miranda, P. Jelínek, N. Martín, D. Écija
    Chemical Communications 56 (2020) 15309-15312.
  2. T. Michnowicz, B. Borca, R. Pétuya, V. Schendel, M. Pristl, I. Pentegov, U. Kraft, H. Klauk, P. Wahl, P. Mutombo, P. Jelínek, A. Arnau, U. Schlickum, K. Kern
    Angewandte Chemie International Edition 59 (2020) 6207 -6212.
  3. J. Berger, M. Ondráček, O. Stetsovych, P. Malý, P. Holý, J. Rybáček, M. Švec, I.G. Stará, T. Mančal, I. Starý, P. Jelínek
    Nature Communications 11 (2020) 1337-1-1337-10.
  4. ACS Sustainable Chemistry & Engineering 8 (2020) 3437-3444.
  5. B. Cirera, A. Sánchez-Grande, B. De La Torre Cerdeño, J. Santos, S. Edalatmanesh, E. Rodríguez-Sánchez, K. Lauwaet, B. J. Mallada Faes, R. Zbořil, R. Miranda, O. Gröning, P. Jelínek, N. Martín, D. Ecija
    Nature Nanotechnology 15 (2020) 437-443.
  6. P. Procházka, M. A. Gosalvez, L. Kormoš, B. De La Torre Cerdeño, A. J. Gallardo Caparrós, J. Alberdi-Rodriguez, T. Chutora, A. O. Makoveev, A. Shahsavar, A. Arnau, P. Jelínek, J. Čechal
    ACS Nano 14 (2020) 7269-7279.
  7. D. Sen, P. Blonski, B. De La Torre Cerdeño, P. Jelínek, M. Otyepka
    Nanoscale Advances 2 (2020) 2986-2991.
  8. J. Doležal, P. Mutombo, D. Nachtigallova, P. Jelínek, P. Merino, M. Švec
    ACS Nano 14 (2020) 8931-8938.
  9. Ch. Wäckerlin, A. J. Gallardo Caparrós, A. Mairena, M. Baljozovic, A. Cahlík, A. Antalík, J. Brabec, L. Veis, D. Nachtigallova, P. Jelínek, K.-H. Ernst
    ACS Nano 14 (2020) 16735-16742.
  10. A. Sánchez-Grande, J.I. Urgel, A. Cahlík, J. Santos, S. Edalatmanesh, E. Rodríguez-Sánchez, K. Lauwaet, P. Mutombo, D. Nachtigallová, R. Nieman, H. Lischka, B. De La Torre Cerdeño, R. Miranda, O. Gröning, N. Martín, P. Jelínek, D. Écija
    Angewandte Chemie International Edition 59 (2020) 17594-17599 .
  11. M.S.G. Mohammed, L. Colazzo, A. J. Gallardo Caparrós, J.A. Pomposo, P. Jelínek, D.G. de Oteyza
    Chemical Communications 56 (2020) 8659-8662.
  12. B. De La Torre Cerdeño, A. Matěj, A. Sánchez-Grande, B. Cirera, B. J. Mallada Faes, E. Rodríguez-Sánchez, J. Santos, J.I. Mendieta-Moreno, S. Edalatmanesh, K. Lauwaet, M. Otyepka, M. Medveď, Á. Buendía, R. Miranda, N. Martín, P. Jelínek, D. Écija
    Nature Communications 11 (2020) 4567(1)-4567(8).
  13. Pablo Merino, M. Švec, Jose Ignacio Martinez, P. Mutombo, César González, José Ángel Martin-Gago, Pedro L de Andrés Rodriguez, P. Jelínek
    Langmuir 31 (1) (2015) 233-239.
  14. V. Zobač, J.P. Lewis, E. Abad, J.I. Mendieta-Moreno, P. Hapala, P. Jelínek, J. Ortega
    Journal of Physics: Condensed Matter 27 (2015) 175002(1)-175002(11).
  15. A.J. Neukirch, J. Park, V. Zobac, H. Wang, P. Jelínek, O. V. Prezhdo, H.-C. Zhou, J. P. Lewis
    Journal of Physics: Condensed Matter 27 (2015) 134208(1)-134208(11).
  16. Sh. Yamazaki, K. Maeda, Y. Sugimoto, M. Abe, V. Zobač, P. Pou, L. Rodrigo, P. Mutombo, R. Perez, P. Jelínek, S. Morita
    Nano Letters 15 (2015) 4356-4363.
  17. K. Iwata, Sh. Yamazaki, P. Mutombo, P. Hapala, M. Ondráček, P. Jelínek, Y. Sugimoto
    Nature Communications 6 (2015) 7766(1)-7766(6).
  18. F. Albrecht, J. Repp, M. Fleischmann, M. Scheer, M. Ondráček, P. Jelínek
    Physical Review Letters 115 (2015) 076101-1-076101-5.
  19. Small 11 (2015) 3686-3693.
  20. M. Corso, M. Ondráček, Ch. Lotze, P. Hapala, K. J. Franke, P. Jelínek, J. I. Pascual
    Physical Review Letters 115 (2015) 136101(1)-136101(5).
  21. M. Telychko, P. Mutombo, P. Merino, P. Hapala, M. Ondráček, F.C. Bocquet, J. Sforzini, O. Stetsovych, M. Vondráček, P. Jelínek, M. Švec
    ACS Nano 9 (2015) 9180-9187.
  22. Noncontact Atomic Force Microscopy vol. 3
  23. Mykola Telychko, J. Berger, Zsolt Majzik, P. Jelínek, M. Švec
    Beilstein Journal of Nanotechnology 6 (2015) 901-906.
  24. Imaging and Manipulation of Adsorbates Using Dynamic Force Microscopy page 81-92 year 2015 ISBN 978-3-319-17400-6 Part of the series Advances in Atom and Single Molecule Machines
  25. M. Ondráček, C. González, P. Jelínek
    Journal of Physics: Condensed Matter 24 (2012) 084003(1)-084003(7).
  26. Journal of Physics: Condensed Matter 24 (2012) 084001(1)-084001(10).
  27. Z. Majzik, M. Setvín, A. Bettac, A. Feltz, V. Cháb, P. Jelínek
    Beilstein Journal of Nanotechnology 3 (2012) 249-259.
  28. M. Setvín, P. Mutombo, M. Ondráček, Z. Majzik, M. Švec, V. Cháb, I. Ošťádal, P. Sobotík, P. Jelínek
    ACS Nano 6 (2012) 6969-6976.
  29. M. Ondráček, P. Mutombo, Z. Chvoj, A. G. Mark, Z. Chromcová, A.B. McLean, P. Jelínek
    Journal of Physics: Condensed Matter 24 (2012) 445003-445016.
  30. A. Yurtsever, D. Fernandez-Torre, C. Gonzalez, P. Jelínek, P. Pou, Y. Sugimoto, M. Abe, R. Perez, S. Morita
    Physical Review B 85 (2012) 125416(1)-125416(9).
  31. M. Švec, P. Merino, Y. J. Dappe, C. González, E. Abad, P. Jelínek, J. A. Martín-Gago
    Physical Review B 86 (2012) 121407(R)-121412(R).
  32. M. Švec, P. Jelínek, P. Shukrynau, C. González, V. Cháb, V. Drchal
    Physical Review B 77 (2008) 125104(1)-125104(8).
  33. P. Jelínek, M. Švec, P. Pou, R. Perez, V. Cháb
    Physical Review Letters 101 (2008) 176101(1)-176101(4).
  34. P. Jelínek, R. Pérez, J. Ortega, F. Flores
    Physical Review B 77 (2008) 115447(1)-115447(11).
  35. B. Pieczyrak, C. González, P. Jelínek, R. Peréz, J. Ortega, F. Flores
    Nanotechnology 19 (2008) 335711(1)-335711(8).
  36. Y.Sugimoto, P. Pou, O. Custance, P. Jelínek, M. Abe, R. Perez, S. Morita
    Science 322 (2008) 413-417.
  37. Y. Sugimoto, P. Pou, M. Abe, P. Jelínek, R. Pérez, S. Morita, Ó. Custance
    Nature 446 (2007) 64-67.
  38. Y.Sugimoto, P. Jelínek, P.Pou, M.Abe, S.Morita, R. Perez, O. Custance
    Physical Review Letters 98 (2007) 106104-1-106104-4.
  39. M.A. Basasnta, Y.J. Dappe, P. Jelínek, J. Ortega
    Computational Materials Science 39 (2007) 759-766.
  40. Z. Kuntová, P. Jelínek, V. Cháb, Z. Chvoj
    Single atom diffusion of Pb on a Si(111)-7x7 surface.
    Surf. Sci. 566-568 (2004) 130 - 136
  41. W. Kaminski, P. Jelínek, R. Pérez, F. Flores, J. Ortega
    Si-substitutional defects on the alpha-Sn-Si(111)-(r3xr3) surface.
    Appl. Surf. Sci. 234 (2004) 286 - 291
  42. P. Jelínek, R. Peréz, J. Ortega, F. Florez
    Mechanical properties and electrical conductance of different Al nanowire submitted to an homogeneous deformation: a first-principles simulation.
    Surf. Sci. 566-568 (2004) 13 - 23
  43. J. M. Blanco, C. Gonzáles, P. Jelínek, J. Ortega, F. Flores, R. Peréz
    First-principles simulations of STM images: From tuneling to the contact regime.
    Phys. Rev. B 70 (2004) 85405