1. M. Setvín, P. Mutombo, M. Ondráček, Z. Majzik, M. Švec, V. Cháb, I. Ošťádal, P. Sobotík, P. Jelínek
    ACS Nano 6 (2012) 6969-6976.
  2. M. Ondráček, P. Mutombo, Z. Chvoj, A. G. Mark, Z. Chromcová, A.B. McLean, P. Jelínek
    Journal of Physics: Condensed Matter 24 (2012) 445003-445016.
  3. Z. Majzik, M. Setvín, A. Bettac, A. Feltz, V. Cháb, P. Jelínek
    Beilstein Journal of Nanotechnology 3 (2012) 249-259.
  4. M. Ondráček, C. González, P. Jelínek
    Journal of Physics: Condensed Matter 24 (2012) 084003(1)-084003(7).
  5. Journal of Physics: Condensed Matter 24 (2012) 084001(1)-084001(10).
  6. A. Yurtsever, D. Fernandez-Torre, C. Gonzalez, P. Jelínek, P. Pou, Y. Sugimoto, M. Abe, R. Perez, S. Morita
    Physical Review B 85 (2012) 125416(1)-125416(9).
  7. M. Švec, P. Merino, Y. J. Dappe, C. González, E. Abad, P. Jelínek, J. A. Martín-Gago
    Physical Review B 86 (2012) 121407(R)-121412(R).
  8. H. Vázquez, P. Jelínek, M. Brandbyge, A.P. Jauho, F. Flores
    Applied Physics A-Materials Science & Processing 95 (2009) 257-263.
  9. M. Švec, V. Dudr, M. Vondráček, P. Jelínek, P. Mutombo, V. Cháb, F. Šutara, V. Matolín, K. Prince
    Surface Science 603 (2009) 2861-2869.
  10. P. Pou, S.A. Ghasemi, P. Jelínek, T. Lenosky, S. Goedecker, R. Perez
    Nanotechnology 20 (2009) 264015-1-264015-10.
  11. R. Bechstein, C. González, J. Schütte, P. Jelínek, R. Pérez, A. Kühnle
    Nanotechnology 20 (2009) 505703(1)-505703(7).
  12. K. Košmider, A. Krupski, P. Jelínek, L. Jurczyszyn
    Physical Review B 80 (2009) 115424(1)-115424(7).
  13. S. Sadewasser, P. Jelínek, Ch.K. Fang, O.Custance, Y. Yamada, Y.Sugimoto, M.Abe, S.Morita
    Physical Review Letters 103 (2009) 266103(1)-266103(4).
  14. P. Pou, P. Jelínek, R. Pérez
    Chapter 11 in Noncontact Atomic Force Microscopy, eds. S.Morita, F.J. Giessibl, R. Wiesendanger, in series NanoScience and Technology, vol. 2, Springer-Verlag Berlin Heidelberger 2009 pp. 227-248.
  15. M. Švec, P. Jelínek, P. Shukrynau, C. González, V. Cháb, V. Drchal
    Physical Review B 77 (2008) 125104(1)-125104(8).
  16. P. Jelínek, M. Švec, P. Pou, R. Perez, V. Cháb
    Physical Review Letters 101 (2008) 176101(1)-176101(4).
  17. P. Jelínek, R. Pérez, J. Ortega, F. Flores
    Physical Review B 77 (2008) 115447(1)-115447(11).
  18. B. Pieczyrak, C. González, P. Jelínek, R. Peréz, J. Ortega, F. Flores
    Nanotechnology 19 (2008) 335711(1)-335711(8).
  19. Y.Sugimoto, P. Pou, O. Custance, P. Jelínek, M. Abe, R. Perez, S. Morita
    Science 322 (2008) 413-417.
  20. Y. Sugimoto, P. Pou, M. Abe, P. Jelínek, R. Pérez, S. Morita, Ó. Custance
    Nature 446 (2007) 64-67.
  21. Y.Sugimoto, P. Jelínek, P.Pou, M.Abe, S.Morita, R. Perez, O. Custance
    Physical Review Letters 98 (2007) 106104-1-106104-4.
  22. M.A. Basasnta, Y.J. Dappe, P. Jelínek, J. Ortega
    Computational Materials Science 39 (2007) 759-766.
  23. Z. Kuntová, P. Jelínek, V. Cháb, Z. Chvoj
    Single atom diffusion of Pb on a Si(111)-7x7 surface.
    Surf. Sci. 566-568 (2004) 130 - 136
  24. W. Kaminski, P. Jelínek, R. Pérez, F. Flores, J. Ortega
    Si-substitutional defects on the alpha-Sn-Si(111)-(r3xr3) surface.
    Appl. Surf. Sci. 234 (2004) 286 - 291
  25. P. Jelínek, R. Peréz, J. Ortega, F. Florez
    Mechanical properties and electrical conductance of different Al nanowire submitted to an homogeneous deformation: a first-principles simulation.
    Surf. Sci. 566-568 (2004) 13 - 23
  26. J. M. Blanco, C. Gonzáles, P. Jelínek, J. Ortega, F. Flores, R. Peréz
    First-principles simulations of STM images: From tuneling to the contact regime.
    Phys. Rev. B 70 (2004) 85405